子宮內膜異位癥是一種復雜的婦科內分泌疾病和免疫性疾病，但是子宮內膜異位癥不是絕對不能自然懷孕。如果出現嚴重的子宮內膜異位癥或子宮腺肌癥，其受孕率下降，可以通過腹腔鏡手術去除局部囊腫和異位結節，嚴重的子宮腺肌癥可以通過手術剝除或者剔除腺肌瘤，來達到一定的治愈效果。 現在子宮內膜異位癥可能更強調體外助孕治療，即試管嬰兒可能更加有效，也可以避免卵巢和子宮的損傷，但是部分嚴重的內異癥或腺肌瘤病人通過體外助孕，也難以達到正常受孕的目的。