雖然針刺麻醉有相對安全、創傷小、適用范圍廣等優點，但缺點也很明顯，具體如下： 1、針刺麻醉效果不能確定，因為所有實施針刺麻醉的醫生，對于所謂穴位掌握常常達不到規范。同時穴位本來就不是很規范的名詞，它有區間范圍，而不是明確的點。所以導致針刺麻醉也許有一定效果，但效果時好時壞，不能滿足于手術需要； 2、僅能夠產生一定輔助鎮痛作用，但沒有任何肌松作用。如果需要做大型胸科腹部手術，沒有肌松作用下腹腔不容易被打開，手術醫生無法看到手術視野需要處理的問題所在，所以針刺麻醉不適合大型手術； 3、針刺麻醉起效需要一定時間，與現在靜脈全麻藥物不同，如丙泊酚，就是做無痛胃鏡常用的藥物，只需要兩分鐘病人就可以處于睡眠鎮靜的狀態，同時有一定鎮痛作用。而針刺麻醉從開始實施到起效，常常需要半個小時的時間，并且半個小時后還不一定起效。所以對于現在此種高效率、快速周轉的手術狀態而言，它完全不能滿足； 4、針刺麻醉在實施之前，還需要跟患者溝通需要注意的穴位，給患者心理上穩定的過程。如果是專業醫生，或許會取得患者信任以及配合。如果患者對醫生表示懷疑，以后就難以取得配合，手術過程中就更難取得麻醉的效果。 因為針刺麻醉有以上缺點，所以現在在我國推廣率還不是很高。