抗核抗體陰性說明體內不存在抗核抗體這種自身抗體，但是需要看檢測方法以及靈敏度，因為任何檢測方法都不能將所有抗體檢測出來。抗核抗體有幾十種不同的檢測方法，檢測的類型不同，敏感性不同，某些檢測方法只能檢測其中的十幾種抗體。抗核抗體陰性，只能說明目前此方法沒有在體內檢測出抗核抗體，在臨床表現以及其他實驗室檢查高度懷疑患有自身免疫病時，需要進行其他相關自身抗體檢查，如抗DNA抗體、抗核小體抗體、抗著絲點抗體等，可對病情進行早期的診斷。