偏頭疼患者腦梗死或者腦血栓形成概率遠高于普通人。在發作或發作過程中避免腦血栓形成，及時終止發作，可以使用鈣離子拮抗劑藥物防止血管過度痙攣以及興奮，造成血管內皮細胞損傷。亦可以調節飲食，避免興奮性的含有酒類、賴氨酸類或腌制食品，另外盡量避免飲用興奮性較強的濃茶、咖啡，減少偏頭痛發作。適當運用預防性藥物，例如鈣離子拮抗劑、抗癲癇藥物，如果偏頭痛患者經常發作時，可以服用上述藥物預防，減少偏頭痛發作，均可以有效減少或者避免腦血栓形成。