常用的阻斷藥包括替諾福韋加拉米夫定，再加依非韋倫或者是克力芝，或者是多替拉韋、拉替拉韋等，這些組合都有一定副作用。 比如替諾福韋藥物，會出現腎臟的損傷，影響骨密度，但如果短時間服用，對骨密度影響不大。產生腎臟損傷建議服用兩周時查腎功，以免對腎臟產生影響。 拉米夫定的副作用相對比較小，克力芝藥物是蛋白酶抑制劑，對HIV病毒實際治療效果非常好。但可能會出現消化道癥狀，比如出現惡心、嘔吐、腹瀉等一系列癥狀。 此外，依非韋倫的副作用包括頭暈、幻覺、精神癥狀。有些人可能會出現副作用，但有些人不會出現，因此個體的差異會影響藥物毒副作用。若兩種藥是整合酶抑制劑，藥物副作用還是比較小，包括將拉替拉韋和多替拉韋這兩種藥物作為阻斷藥，其毒副作用相對比較小。 因為阻斷藥都需要自費的，要根據經濟情況決定服用藥物。服用阻斷藥以后要進行肝功能、腎功能的監測，通過監測能夠及時發現是否有明顯的毒副作用。