單純的門靜脈癌栓會提示肝癌預后比較差，但肝癌是不是晚期，還要通過門脈癌栓的具體分型再定。根據日本肝癌協會所制定的肝癌分期，如果是早期，如0期或者1期的門靜脈癌栓，只要通過手術一并切掉，術后的效果跟沒有癌栓的肝細胞肝癌的病人相差不多。如果門靜脈癌栓侵犯到二級分支或者一級分支，甚至侵犯到一級分支或者主干，術后的效果，以及手術的風險也會增加，做完手術之后的效果比較差。如果術后的病理確實是門靜脈癌栓，不是血栓，早期除了手術之外，也可以通過靶向或者免疫治療，進行早期的阻斷，降低再次復發或者轉移的概率。雖然從醫保政策上說，做手術的病人醫保的報銷比例比較低。但是對于臨床醫生來說，只要術后的病理或者術前的檢查考慮門靜脈癌栓，通常還是建議進行靶向和免疫治療為主的早期干預，減少復發及轉移的概率。