兩側太陽穴脹痛的原因較多，具體如下：1、感冒、發燒：可以出現兩側太陽穴發脹、疼痛，還會出現頸部酸痛、四肢乏力等綜合癥狀；2、擴張血管藥物副作用：可以使腦部血管擴張，出現兩側太陽穴脹痛；3、其它：失眠、壓力大、用腦過度、高血壓等疾病也可以造成兩側太陽穴發脹、疼痛等情況。兩側太陽穴的脹痛只是臨床癥狀，可能是很多疾病的表現，應該參考患者其他癥狀、體征，參考影像學檢查以及其他檢查線索，從而進行綜合分析。出現此類情況的患者應該及時就診，找到病因進行對因治療加上對癥治療的綜合治療，包括藥物治療、理療、心理疏導、環境改變等，從而可以爭取較好的預后。