肛門用止痛栓同樣存在副作用，目前臨床常用的有對乙酰氨基酚止痛栓和吲哚美辛止痛栓，其具體副作用如下：1、對乙酰氨基酚止痛栓：對乙酰氨基酚屬于解熱鎮痛藥，通常對消化道、肛門有一定刺激，同時可產生過敏、皮疹、瘙癢、出汗等副作用，另外對肝腎功能也有一定損傷；2、吲哚美辛止痛栓：吲哚美辛屬于非甾體抗炎藥，其止痛栓也體現出相應副作用，如對胃腸道、肛門局部產生刺激作用，引起疼痛、不適。另外還對肝腎功能有一定損傷，如造成轉氨酶升高。