結膜炎和角膜炎不同，結膜和角膜是眼睛的兩個不同部位。結膜是俗稱的白眼球，還包括眼瞼里的瞼結膜，角膜是俗稱的黑眼球。在不同部位的病變可有不同表現，但原因有一部分可以相同，如感染，都可由細菌或病毒感染引起。 角膜炎相對結膜炎較嚴重，因為角膜是透明器官，一旦感染發生炎癥，會留下角膜瘢痕，從而影響視力，結膜炎可能對視力損傷比較小。此外，如果是角膜外傷，也會導致角膜混濁、角膜瘢痕。結膜也可有外傷，如結膜裂傷，但對眼部功能影響相對較小。