腎結石體外碎石在十幾年前認為此項手術沒有任何危害，但是后來發現體外碎石對腎臟還是有一定的損傷。有的結石病人做手術過程中發現切下來的腎臟，做病理檢查發現有腎小球、腎小管破壞，這才意識到是多次體外碎石對腎臟的損傷。現在原則上是有腎結石的患者，如果結石在0.5-1cm，優選體外碎石。而且體外碎石最多用2次，每次間隔2周。如果體外碎石不能良好地把結石打碎，就立即轉用體內碎石的方式。因為做輸尿管鏡雖然有一定的輸尿管損傷，但是和體外碎石對腎臟的損傷相比，損傷小得多。