男孩開始發育陰莖的主要高峰期為進入青春期時，即12-18歲期間。男孩陰莖絕大多數在出生時可看到，出生時顯然陰莖與其他器官同樣較小，直至青春期前伴隨身高增長，陰莖也會出現輕微生長，但直到青春期前發育均較遲緩，睪丸體積發育也不會較明顯。進入青春期開始，睪丸體積開始逐步變大，所產生的性激素也開始逐步增加，并逐漸開始出現第二性征，如喉結、陰毛、胡須等，而陰莖也在此階段開始發育。發育具有時間特點與睪丸發育以及性激素增加有直接關系，而整個性發育過程與第二性征產生過程基本同步。大概在12-14歲開始伴隨身高增加、睪丸增大，以及第二性征出現，陰莖開始逐步變長與變粗。如果到13歲左右未出現明顯發育，建議到醫院進行檢查與必要的治療。通常發育會在18歲左右青春期結束時停止，伴隨睪丸發育以及身高增長停止，此后陰莖不再發育。