小腹疼痛時主要的檢查為腹部CT、超聲以及各種化驗室檢查，如血常規、生化檢查，必要時可進行肛門指診以及陰道內診，從而明確是否存在炎癥性疾病。存在小腹部疼痛時應根據影像學檢查、實驗室檢查以及體格檢查綜合判斷疼痛原因和具體部位。男性小腹部主要有腸管、膀胱以及雙側輸尿管等臟器，而女性小腹部除上述臟器外，還有子宮、雙側附件等臟器。上述臟器或器官出現炎癥性、腫瘤性、出血性疾病時，均可導致小腹部疼痛。而為明確相關診斷，尤其是區分婦產科疾病，超聲、CT較為常用，超聲下可觀測腹痛部位是否有可疑腫物或腹、盆腔內是否存在游離積液。超聲配合化驗室檢查結果為明顯貧血時提示存在出血情況，女性較常出現此類情況。