喉鏡操作通常從嘴巴進入至咽喉部，但也存在特殊情況。比如部分患者同時行電子鼻炎鏡和電子喉鏡檢查，此時通常從鼻子進入，然后從后鼻孔直接進入咽喉部，則不必要將鼻子檢查完畢后，再取出換另外一個鏡子，然后從嘴巴進入。部分小孩行喉鏡檢查時，不愿意張嘴，此時也無法行喉鏡檢查，也可以從鼻子進入查看咽喉部情況。不管從鼻孔還是從嘴巴進入，其檢查部位是直視下無法看到的部位，如張嘴可以查看扁桃體、咽喉壁情況。行喉鏡檢查需要觀察的是直視下無法看到的解剖結構，如會厭部、聲帶部位、梨狀窩等。這些部位無論是從鼻子還是從嘴巴進入，都可以清楚觀察到具體情況。但一般行喉鏡檢查時，先要予以黏膜的表面麻醉。這樣在行喉鏡檢查時，才不會產生惡心、嘔吐、疼痛等不適。