對于多年鼻竇炎是否可以根治，目前尚有一定爭論，有人認為竇腔上皮化后即根治，有人認為竇腔雖然上皮化，但仍有再發鼻竇炎的可能，不能稱為根治。對于多年的鼻竇炎，建議進行規范的藥物治療，通常療程為12周左右，可以通過鼻用糖皮質激素、黏膜促排劑治療，比如標準桃金娘油、桉檸蒎腸溶膠囊，以及大環內酯類口服藥物。進行上述規范治療后，如果仍然無效，或者存在竇口鼻道復合體的機械性堵塞，此時建議行鼻竇內窺鏡手術。如果鼻竇內窺鏡手術后，鼻竇竇腔黏膜上皮化較好，稱為臨床治愈。但即使是臨床治愈的鼻竇炎，也有一定復發的可能性，比如感冒、急性鼻炎未得到有效控制，可能再一次伴發鼻竇炎。