妥布霉素是兒童較常用的消炎眼藥水，兒童可使用的消炎藥水并不多，常用藥水有妥布霉素、左氧氟沙星，也可以使用金霉素、紅霉素、夫西地酸滴眼液等。妥布霉素無法全身用藥，研究認為全身用藥時會有一定程度的滲透性，但一切離開劑量，談毒性都不合適、不合理。妥布霉素的用法是滴在眼球表面，而且進入全身的藥效微乎其微，滴在眼球表面的藥水其實對全身無法產生較大影響。因此臨床上妥布霉素是最常用的消炎藥水，尤其適合新生兒。通常扒開下眼窩，將消炎藥水滴入下眼瞇縫里。滴眼液主要在白天使用，操作較方便，但隨著眨眼，藥水可較快流出。因此通常是白天滴眼藥水，睡覺時涂眼膏，藥店和醫院有專門的妥布霉素類眼膏。