抗癲癇藥物常見的不良反應為過敏性皮疹，其他不良反應則與具體藥物有關，若為丙戊酸鈉則可引起女性內分泌異常，出現激素型肥胖，甚至影響卵巢功能，出現多囊卵巢綜合征，影響正常生育。若女性在妊娠期服用丙戊酸鈉類抗癲癇藥物，則可引起胎兒畸形的發生；如奧卡西平、卡馬西平，可引起眩暈、惡心、嘔吐等胃腸道反應或低鈉血癥表現，劑量較大時可影響患者智力發育或語言功能。因此，臨床用藥應由專業醫生綜合評估患者個體情況后進行選擇，進而使藥物作用發揮得更好，降低對患者的影響。