房間隔缺損的心電圖特點和房間隔缺損的大小有關系，小型的房間隔缺損心電圖可以表現得輕微異常，甚至是正常。較大的房間隔缺損因為伴有右心房和右心室的肥大，典型的心電圖表現可以為心電圖的右偏，還有不完全性或者是完全性右束支傳導阻滯、P波增高或者是增大、PR間期的延長。原發孔房缺也可以見于電軸的左偏及左心室的肥大，癥狀相對比較嚴重。出現心衰的患者可能會伴有心肌勞損，也就是ST波的改變。中老年患者出現室上性心律失常也相對比較常見，起初可以表現為陣發性的房顫，后期房顫可以持續存在。