通常拔牙一定要拔凈牙根，因為剩余的牙根內部有牙神經，牙根拔不干凈，術后將出現疼痛。牙神經暴露在拔牙窩內，如果殘存牙根比較長，內部神經殘存也比較長，此時容易出現術后殘髓炎，即殘存的牙神經發炎，會出現殘根疼痛。此外，牙根拔不干凈，容易出現拔牙窩感染，或者是拔牙窩不愈合。但是有少數情況，可以保留一點牙根，但前提是牙根尖沒有炎癥，通過術前X線檢查可確定。剩余牙根不超過3mm，此時可以不拔，牙根離重要結構特別近，拔除時風險比較高，也可以先不拔得比較干凈。可根據術后有無反應而定，如果沒有反應可以不全部清除，如果有不良反應，再進行二次手術將其拔除干凈。