幽門螺桿菌感染陽性往往提示體內存在幽門螺桿菌的感染，如果沒有特殊禁忌癥，可以選擇根除幽門螺桿菌，但也并不是全部患者均需根除幽門螺桿菌。對于高危人群，如存在胃癌家族史的人群、萎縮性胃炎、糜爛性胃炎、消化性潰瘍，或者是曾經胃部做過手術，存在殘胃炎，以及既往患有胃早癌或胃黏膜相關性淋巴瘤的患者均應根除幽門螺桿菌。如果患者長期服用阿司匹林、氯吡格雷等存在胃黏膜損傷副作用的藥物，也應根除幽門螺桿菌，防止多重致病因素對胃黏膜產生刺激。但如果沒有上述危險因素，并且患者年齡較大，在沒有癥狀時，應用根除幽門螺桿菌的抗生素有可能會誘發抗生素相關性腹瀉、偽膜性腸炎，從而導致難治性腹瀉，甚至大便帶有黏液、膿血。根除幽門螺桿菌推薦四聯療法，即兩種抗生素、質子泵抑制劑、鉍劑，并且建議在醫生指導下明確是否需要根除幽門螺桿菌。