幽門螺桿菌感染陽性，根據感染的程度可以選擇三聯或四聯藥物進行根除，通常使用兩種抗生素，包括青霉素類的阿莫西林、喹諾酮類的左氧氟沙星或是硝基咪唑類的甲硝唑、呋喃唑酮以及大環內酯類的克拉霉素等。上述藥物任選兩種，但青霉素過敏者不要選擇青霉素類的制劑。三聯療法為兩種抗生素加用一種質子泵抑制劑，包括奧美拉唑、雷貝拉唑、泮托拉唑、埃索美拉唑等，任選其一即可。四聯療法是在三聯的基礎上加用鉍劑，包括膠體果膠鉍、枸櫞酸鉍鉀或復方鋁酸鉍等。鉍劑會導致舌頭、大便黑染，患者要注意識別，不需要緊張。臨床可以根據呼氣試驗的結果選擇療程，停藥1個月后需及時復查。