中醫治療胃腸功能紊亂較有優勢，如治療功能性消化不良、功能性便秘、功能性腹瀉等。以功能性消化不良為例，表現為上腹部飽脹疼痛、餐后不適，西醫方面會食用促進胃蠕動的藥進行治療，有胃痛、反酸、燒灼樣疼痛的病人，可能還會加用抑制胃酸分泌的藥物，只對部分病人產生不錯的效果。對于效果不好的病人，可以用中藥進行辨證施治，如與情緒有關的病人，出現肝胃不和、肝郁氣滯等，可以進行疏肝和胃、理氣消脹治療，給予柴胡疏肝散、四逆散、逍遙丸等，效果顯著。部分年老體衰、臟腑功能不足、大病久病之后的病人，會出現脾虛氣滯、胃脹、早飽、胃脘部疼痛等消化不良表現，需要健脾益氣、和胃消脹的方法治療。對脾虛氣滯的病人，可以用香砂六君子湯、陳夏六君子湯治療，也會有很好的效果。