肛周膿腫的治療費用目前無統一標準，與膿腫大小、位置、手術方式、所在醫院、地區等有關。一般來說，單純的肛周膿腫切開引流術治療費用相對較低，根治術治療費用相對較高，大概需要8000-10000元。 此外，如果肛周膿腫體積較大，位置較深，手術創面較大，住院時間較長，治療費用相對較高。反之，肛周膿腫體積較小，位置表淺，手術創面小，住院時間短，治療費用相對較少，應在醫生指導下根據自身病情選擇適合的治療方法。