肛竇炎，是肛隱窩、肛門腺的急慢性的炎癥性的感染病，其病理組織改變是局部的充血水腫、組織增生。肛竇炎發病因素有三個，首先是感染損傷，干結的糞便因摩擦損傷肛腺，導致糞便淤積、細菌繁殖，從而導致肛腺的感染；其次是胚胎發育的影響，肛周膿腫、肛瘺的肛隱窩比正常人深，數量較多，增加肛腺感染的機會；第三是性激素的影響，性激素調節肛腺的發育和功能的完善，直接影響肛腺的萎縮和增生，導致肛竇炎。