肛竇炎可以自愈。在肛門2cm處有一個齒狀線，齒狀線是直腸和肛管的分界線，齒狀線上面是肛竇，為淺窩，大便時大便會通過肛竇排到肛管上，最后排出體外。如果肛竇里面殘存了大便殘渣，時間久了有可能引起細菌感染，導致肛竇炎，出現肛門疼痛或者其他癥狀。肛竇炎發生以后，如果大便維持比較好、大便比較通暢，殘存在肛竇里面的殘渣排到體外，肛竇炎有可能慢慢好轉。如果肛竇炎較長時間不好，食物殘渣或細菌逐漸引起感染，感染越來越嚴重，可能會穿破腸黏膜，穿破腸黏膜以后會到達皮下組織，引起肛門膿腫，肛門膿腫多半是肛竇炎所引起，有可能引起肛瘺。所以，肛竇炎可以自愈，如果沒有得到治療或沒有自愈，可能會發展為肛門膿腫或肛瘺等嚴重情況。