縱膈腫瘤的病因目前尚未明確，臨床認為可從家族史、生活習慣、隨訪情況等方面進行研究。有家族史的患者，建議定期進行胸部CT掃描，早期篩查能夠得到早期治療，以減小縱膈腫瘤的危害。據胸科醫院數據統計，腫瘤的發生與家族史、生活習慣、基因突變有較大關系。如上海胸科醫院，在1957-1999年報告提出2638例縱膈手術中，患者術后病理占前三位的為胸腺瘤、畸胎瘤和胸腺囊腫，兒童所占比例中有73%為良性，20-40歲的男性患者中有40%為惡性。