膽管結石，尤其肝內膽管結石的患者通常無特異臨床癥狀，合并梗阻、感染者，表現為寒戰、高熱、腹痛、黃疸，全身皮膚、粘膜發黃，大便顏色發白，尿液顏色深，引起肝功能異常。除此之外，結石坎頓可誘發膽源性胰腺炎，引起左上腹疼痛、淀粉酶升高，急性膽管炎進一步進展可危及生命，應及時到醫院就診。臨床上首選腹部超聲檢查，進一步進行MRCP觀察膽管內結石情況。對于反復發作的慢性膽道炎癥患者，也可以通過CT檢查，進一步評估肝膽系統及周圍組織的病變情況。