矮小癥治療持續時間取決于病因、矮小程度和對身高增長的預期值。若因生長激素缺乏導致矮小，通常使用生長激素注射治療，在患兒骨齡接近或達到普通孩子身高時停止治療。臨床中常見特發性矮小，包括家族遺傳性矮小癥。若患兒身高比普通兒童低兩個標準，需一直進行治療。治療時需排除患兒有無生長激素治療的禁忌癥，如糖尿病、腫瘤、脊柱側彎等。治療時間通常持續兩年以上。