矮小癥治療的最終目標是成年后達到理想身高，臨床目前認為男孩理想身高是1.725m。因憑借難以判斷成年后的身高狀態，治療時需分階段進行。首要目標是達到某年齡段的平均身高。若身高與平均身高相差10cm，可能需兩年時間；若與平均身高相差5cm，治療時間可能需要一年。因生長激素治療矮小癥是持續過程，且需持續監測，臨床要求治療時間最短為一年。