醫學上普遍認為幽門螺桿菌如果不治療，可能長期存在。部分患者初期無癥狀，可能經過數年后，胃病的癥狀才表現出來，所以對于幽門螺桿菌感染的患者，需進行有效的根除治療。幽門螺桿菌是否能根治，與診斷及檢查密切相關。除非患者做過血清學抗體檢測，或者基因學檢測，否則進行細菌呼氣試驗之前，患者需停用抗菌素一個月以上，停用鉍劑和質子泵抑制劑兩周以上，才能取得比較準確的檢測結果。