胃食管反流術后，早期最常見的并發癥有兩個，一個是圍手術期的出血，部分肝病患者凝血功能異常，周圍血管靜脈曲張，更易出血；另一個是對于胃底、胃壁的游離，引起的胃壁缺血、壞死、甚至穿孔，形成胃壁瘺，此外如果賁門部收縮過緊，患者術后早期可能有進食哽咽感，部分患者可出現進食量減少，也可出現少量進食后胃部的飽脹感。