膽石癥術后并發癥取決于膽結石部位、手術方式。膽囊結石，手術方式簡單，做肝膽外科最常見的腹腔鏡下膽囊切除術。隨著技術提高，并發癥發生很少，但是偶爾有以下并發癥。手術中膽道損傷、出血、感染。 但膽管結石，特別是肝內膽管結石，處理非常復雜，并發癥更多。肝內膽管結石處理，切除病灶，把肝臟切掉部分，去除結石，所以會帶來相關并發癥增大，比如切除肝臟，出現手術當中、術后出血、感染情況。常見并發癥是出血、感染、肝功能損傷。