先天性心臟病，指左心房、右心房、左心室、右心室、室間隔、房間隔、大動脈、主動脈，以及房室、血管之間的瓣膜等任何結構出現異常所致的疾病。影像學檢查可以很好地觀察到結構缺失、異常。先天性心臟病發生于新生兒，此時身體組織處于代謝旺盛的狀態，人體細胞DNA自我復制旺盛，基因易受到射線的影響。心臟CT檢查會發射X射線，對患兒產生一定傷害。磁共振產生低頻率的電磁波，對人體傷害可以忽略不計，適合于小兒先天性心臟病的檢查，可以明確診斷房間隔缺損、室間隔缺損、動脈導管未閉、法洛四聯癥等常見心臟病。