女性肚子疼就診科室需根據位置和檢查情況而定，主要為婦產科和普外科，具體如下：1、下腹偏右疼痛：考慮是否存在蒂扭轉或宮外孕破裂等婦科疾病或普外科闌尾炎；2、中下腹疼、臍周臍下疼痛：考慮泌尿外科膀胱炎、泌尿系統感染以及膀胱結石；3、左下腹痛：考慮泌尿外科結石、克羅恩病或潰瘍性結腸炎；4、臍周痛：考慮腸梗阻，兩側疼痛多考慮結腸問題；5、上腹痛、右上腹、左上腹：考慮普外科膽囊、胰腺以及肝臟異常。特殊情況右下腹痛，檢查發現為大葉性肺炎，可就診于呼吸科。女性肚子疼需要明確位置，針對檢查最終決定就診科室。