自身免疫性腦炎治愈率現在還沒有統計學的數字，但是現在自身免疫性腦炎的治愈率比較高，臨床中遇到的大部分都能治好、治愈。因為自身免疫性腦炎，從2007年全世界第一例報道以來，很多的文獻報道都是小樣本的一些數據。因為小樣本的數據沒有太多的參考意義，現在自身免疫性腦炎也逐漸被認識，并且治療方案也逐漸在完善，治愈率非常高。在臨床中遇到的自身免疫性腦炎，基本上不是100%，但是大部分都能治好。有一部分自身免疫性腦炎有復發的傾向，比如治好后，過了半年、一年，可能又回到醫院，檢查會發現自身免疫性腦炎復發。所以治愈率雖然很高，但是有復發的可能。現在自身免疫性腦炎治療手段還比較多，大部分都能治愈。