治療結膜炎癥沒有最好的眼藥水，只有最合適的眼藥水，需要了解結膜炎的原因再進行處理，具體內容如下：1、細菌性結膜炎：可以使用抗生素眼藥水，目前臨床上一線抗生素眼藥水是氧氟沙星眼藥水或者妥布霉素眼藥水。抗生素眼藥水不能濫用，因為容易造成耐藥性；2、過敏性結膜炎：需要根據過敏時間決定用什么眼藥水，在急性期可以使用激素類眼藥水或者人工淚液輔助使用，在慢性期可以用抗過敏眼藥水。另外可以在過敏發生之前開始點用抗過敏眼藥水，達到一定預防作用；3、其他炎癥：比如因為慢性淚囊炎導致結膜炎，因為角膜炎導致結膜炎要治療原發病灶。淚囊炎只能通過做手術解決結膜炎癥，病毒性角膜炎需要抗病毒治療，才能治療結膜炎癥。