兒童結膜炎治療所選擇用的藥物范圍較窄，妥布霉素為普遍適合兒童的藥物。但部分地區無法采購妥布霉素，則可選擇無防腐劑的左氧氟沙星類藥水，其屬于喹諾酮類。此外，亦可選擇利福平類、磺胺類藥物，但磺胺類藥物可引起部分兒童過敏反應，需謹慎使用。因此，家長為兒童選藥時，需考慮抗菌能力、防腐劑、過敏等問因素，盡量前往醫院檢查，根據病因針對性用藥。