卵巢囊腫手術具體時間，需根據手術難易程度以及卵巢囊腫性質而定，不同的手術難易程度不同，手術操作過程中可能發生的風險和并發癥也不同。對于卵巢單純性囊腫或漿液性囊性瘤，以及黏液性囊性瘤等，如果本身卵巢囊腫周圍組織沒有粘連，手術操作過程比較快，只要將囊腫剝除或附件切除，如果不計算麻醉時間大約0.5-1小時就可以結束。對于卵巢子宮內膜異位囊腫或可能發生惡性病變的卵巢囊腫，手術時間會有所延長。卵巢子宮內膜異位囊腫也稱為卵巢巧克力囊腫，它是盆腔子宮內膜異位癥的表現形式，會導致盆腹腔廣泛粘連。由于子宮內膜異位病灶反復出血，導致盆腔內纖維組織增生，就會導致器官組織間形成粘連，可能會出現輸卵管、卵巢、子宮、盆腔、腹膜、甚至與膀胱和直腸都會出現粘連的現象，對于手術操作就會造成很大的不利因素，手術時間就會相應延長。