鼻咽部和眼睛沒有直接相連，因此鼻咽癌早期不會引起眼部病變。鼻咽部的位置靠近腦干中的中樞神經系統，顱神經中有很多對與眼睛有關，因此會引起眼部病變。視神經被侵犯，則會導致患者失聰；動眼神經支配眼球固定肌肉，被侵犯以后導致眼睛活動受限出現復視；滑車神經支配眼球運動，被侵犯以后導致眼球不能運動；侵犯三叉神經，會出現眼瞼下垂、面部麻木。