主動脈夾層動脈瘤術后常見的并發癥有腦缺氧或高血壓患者不耐受術中低血壓環境，造成缺血，還包括對其他臟器的損害，如腎臟，肝臟。主動脈夾層動脈瘤并發癥取決于手術方式和病情嚴重程度，病情越嚴重、病變范圍越大，手術后并發癥越多，如缺血、神經損傷。若病變較輕、范圍較小，微創手術后產生并發癥幾率約為1%-2%。建議根據患者的具體情況，選擇并發癥最少的手術方式，以達到較好預期效果。