下咽癌的預后在所有頭頸腫瘤中（包括喉癌、下咽癌、口腔癌、鼻咽癌等），預后相對較差，由于下咽癌缺乏典型癥狀，臨床上很難做到早期發現、早期治療，多數患者發現時已經屬于中晚期，治療效果受到明顯影響。一般而言，Ⅰ期五年生存率在70%以上，但臨床上很難發現早期下咽癌患者，Ⅱ-Ⅲ期五年生存率在50%-60%，Ⅲ-Ⅳ期五年生存率在30%-40%。與喉癌相比，晚期患者五年生存率相對較低。