滴蟲性陰道炎治療原則遵循夫妻雙方同治。陰道毛滴蟲通常于厭氧環境下滋生，一般用抗厭氧菌類藥物，常用甲硝唑、替硝唑、奧硝唑等。 最早使用口服甲硝唑類藥物，對胃腸道有刺激癥狀，采取早晚各兩片連續服一周，亦可采取一次服十片，但對胃腸道刺激較重，需根據個人情況選擇。局部用藥，常用甲硝唑的泡騰片或者雙唑泰，還可以選擇中成藥的栓劑，保婦康栓、康婦凝膠等。