滴蟲性陰道炎通常會選擇硝基咪唑類藥物來進行治療，比較常用的藥物是甲硝唑和替硝唑，通常進行滴蟲性陰道炎治療的時候會選擇全身用藥。而且由于滴蟲性陰道炎主要是通過性生活所傳播，因此，患有滴蟲性陰道炎的時候會要求夫妻同治。由于滴蟲性陰道炎比較容易復發，滴蟲比較容易隱藏在陰道的皺褶以及男性的包皮等部位，因此，在進行治療之后連續三個月，都要求每次月經干凈之后，需要到醫院復查白帶常規是否有陰道毛滴蟲。如果在復查的時候發現沒有徹底治愈，則需要再次給予一個療程的療效藥物治療。為了保證滴蟲性陰道炎能夠徹底根治，務必要在進行治療之后按期復查，連續三個月的月經周期之后檢查都沒有發現有滴蟲存在時，才能說明滴蟲性陰道炎已經被徹底治愈。