松果體囊腫通常不會破裂。松果體囊腫為先天性疾病，可能長時間不會持續增大。若發現此類疾病，應定期進行觀察隨訪，1-2年進行一次頭部CT或者核磁檢查，密切關注囊腫大小，若無任何變化，則問題不大，無需進行特殊處理。若觀察過程中發現囊腫存在明顯增大，甚至出現由于腦積水導致顱內壓增高的癥狀，比如頭疼、頭暈、惡心、嘔吐、視神經乳頭水腫等，或者引起神經功能缺失，比如下丘腦、同向凝視等癥狀。此時應進行手術切除，包括傳統的開顱手術與微創手術方式，通常內鏡下囊腫切除術，術后患者恢復較快、預后較好，無需特別擔心。