松果體囊腫通常是一種先天性囊腫，是在胚胎發育過程中逐漸形成的一類囊腫。大部分松果體區的囊腫，特別是松果體區比較單純的囊腫，在后天的觀察過程中，一般保持相對靜止的穩定狀態，囊腫體積不是很大，也不容易引起腦積水或者其他癥狀。對于沒有任何癥狀的松果體囊腫，只是在神經影像學，特別是頭顱磁共振檢查時，才發現有病變，一般也不需要處理。如果松果體囊腫體積比較大，引起了梗阻性腦積水或者對周圍的結構形成壓迫，從而引起神經系統癥狀，需要考慮通過手術的方式處理囊腫，改善患者腦積水的情況以及神經系統的癥狀，這類手術通常是神經內鏡的手術治療。所幸大部分松果體囊腫是由于先天的細胞殘留在局部，形成的囊腫，在后天的隨訪過程中保持穩定，也不引起癥狀。所以大部分松果體囊腫無需進行手術治療，只有很少數部分囊腫，由于引起患者出現癥狀，或者是引起梗阻性腦積水等情況，才需要進行神經外科手術干預。