甲狀腺囊腫超聲介入微創治療指征與甲狀腺良性結節相似，甲狀腺囊腫多為良性，單純囊腫較少為惡性。囊腫并非全部需要治療，囊腫增大后壓迫甲狀腺實質，如大于2cm對甲狀腺實質壓迫較明顯，需進行治療。囊腫小于2cm但生長速度較快，此時需進行硬化治療。非常小的囊腫，如小于1cm，對甲狀腺實質壓迫不明顯，可定期觀察，暫不需要治療。