奧美拉唑和阿莫西林兩種藥物沒有明顯的藥物相互作用，可以一起服用，但一般情況下不會同時服用，因為兩種藥物用來清除幽門螺桿菌感染時是需要同時服用。 除上述兩種藥物外，還需要加用一種抗生素和鉍劑，即通常說的清除幽門螺桿菌的四聯療法。 這兩種藥物不需要同時吃，因為奧美拉唑一般是需要飯前半小時服用，然而阿莫西林是在飯后半小時服用，所以這兩種藥物一種在飯前服用，另一種在飯后服用。雖然兩種藥物沒有明顯的相互作用，但是也能不同時服用。