扁桃體結石的病人會常有口腔異味、口臭，或者咽部異物感、嗓子刮磨感，這種情況輕度可以用漱口或者含片、噴劑等辦法，比如可以用專用的漱口水口泰含漱液，或者用3%的雙氧水進行稀釋，稀釋完之后可以漱口。 扁桃體的結石可能會并發厭氧菌的感染，口臭會更明顯，也可以進行霧化吸入的治療，或者用含片、噴劑等。另外，需避免誘因，如抽煙、喝酒、進食刺激的食物，避免著涼、感冒，如果以上方法都不能減少口臭或者口腔異味，則需要進行手術治療，將扁桃體切除。 如果扁桃體結石長的頻率不快，或者癥狀不嚴重，也可以用扁桃體隱窩口灌洗的方法，或者定期到醫院清理扁桃體隱窩口的結石，對于緩解口臭有一定的幫助。