小兒慢性咽炎需要進行對癥治療，找對病因、消除病因，才能達到較好的治療效果。目前市面上并沒有一種藥可以通治任何種類的小兒慢性咽炎，因為小兒慢性咽炎的成因不同。 如果是由于小兒鼻炎、鼻竇炎引起的慢性咽炎，首先要治療小兒鼻炎、鼻竇炎，另外如果是由于患兒的消化系統疾病引發，首先需治療消化系統疾病，小兒的消化系統問題多見于進食過多，導致積食。 因而小兒慢性咽炎的治療屬于綜合治療，在去除病因的同時需輔以清熱、利咽的中藥泡水喝，如石斛、胖大海等。