常規的牙齒矯正對患者無直接傷害。患者由于佩戴矯治器，不利于口腔清潔，導致菌斑形成，引發蛀牙。佩戴矯正器初期，患者通常出現暫時性的疼痛和輕微的牙齒松動，均為正常現象，一般幾日內可自行緩解，如癥狀嚴重，需暫停矯治，待其緩解后繼續進行。牙齒矯正的過程一般持續2-3年，如正畸較快、正畸力過大，可導致牙根吸收、牙齒疼痛、牙槽骨吸收等副作用。研究表明正畸不會引起顳頜關節的紊亂。