腸鏡檢查主要包括兩方面，檢查功能和治療功能。檢查功能是病人如果出現腹痛、腹瀉、大便習慣、性狀改變，甚至便血癥狀后，此時結腸鏡檢查指征非常強。病人有腫瘤家族史，一般四歲左右時雖沒癥狀，可選擇結腸鏡檢查。高度懷疑結腸腫瘤時，或有部分腸梗阻表現，懷疑腸道有器質性疾病時，需結腸鏡檢查。慢性結腸炎或結腸術后改變，需定期復查，也需結腸鏡檢查。 治療功能為腸鏡下可做息肉內鏡切除或下尿道出血，包括血管畸形、憩室出血的止血治療。如果腸道狹窄，可植入支架緩解癥狀。